Padre Martin fu tra i pochi che ebbero il privilegio,di conoscere il terzo segreto di Fatima,precisamente da uno di coloro che lo lessero nel 1959,il cardinal Bea di cui era segretario. Padre Martin sacerdote esorcista ( celebrò per tutta la sua vita la Santa Messa secondo il rito antico ) rivelò che il segreto era diviso in due parti , uno riguardava il papa e l'altro era il seguito, delle parole di Suor Lucia ( in Portogallo si conserverà sempre il dogma della fede ecc.. ) “ Padre Malachi Martin riguardo all’antipapa eretico e dell’apostasia nel Terzo Segreto, disse: "Fosse solo quello." L’antipapa e i suoi collaboratori apostati saranno (come li chiama Suor Lucia) i partigiani del diavolo (os partidarios do demonio) "i quali lavoreranno per il male e non avranno paura di niente". Sono questi "partigiani del demonio" che costituiscono il "terzo delle stelle del cielo" precipitate sulla terra dalla coda del drago. Questi uomini che si nascondono come clero "Cattolico" sono in realtà membri segreti della setta e sono consacrati al demonio. Essi otterranno il controllo dell’apparato Vaticano e creeranno il "ramo" cattolico di una nuova religione ecumenica mondiale. La loro "chiesa" contraffatta sarà Cattolica solo di nome. Essa formerà la parte "Cattolica" della religione imposta e asservita dal Nuovo Ordine Mondiale. Il vero Cattolicesimo sarà considerato fuori legge, ed i fedeli Cattolici che rimarranno saldi nella loro vera fede, saranno soggetti alle più feroci "persecuzioni" che si siano mai viste nella storia.